Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED1O96006 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms