Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDST3O95803 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDST3O95803 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDST3O95803 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDST3O95803 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDST3O95803 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NDST3O95803 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NDST3O95803 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NDST3O95803 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDST3O95803 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDST3O95803 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms