Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN9O95484 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CLDN9O95484 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLDN9O95484 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN9O95484 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN9O95484 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN9O95484 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN9O95484 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN9O95484 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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