Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB6O95452 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB6O95452 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB6O95452 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB6O95452 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB6O95452 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB6O95452 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB6O95452 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB6O95452 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms