Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAPBO95292 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAPBO95292 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAPBO95292 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAPBO95292 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VAPBO95292 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms