Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN3O95197 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN3O95197 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN3O95197 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN3O95197 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN3O95197 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN3O95197 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN3O95197 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN3O95197 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTN3O95197 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTN3O95197 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTN3O95197 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN3O95197 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN3O95197 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN3O95197 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms