Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF6O94906 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms