Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG12O94817 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG12O94817 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG12O94817 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG12O94817 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG12O94817 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATG12O94817 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms