Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALDH1A2O94788 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALDH1A2O94788 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms