Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA4O75335 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms