Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP2O75323 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP2O75323 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms