Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
ABCC9O60706 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC42.82■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
ABCC9O60706 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms