Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KIAA0556O60303 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KIAA0556O60303 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KIAA0556O60303 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KIAA0556O60303 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
KIAA0556O60303 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KIAA0556O60303 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KIAA0556O60303 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms