Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL13O43927 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms