Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIF1CO43896 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIF1CO43896 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIF1CO43896 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIF1CO43896 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIF1CO43896 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIF1CO43896 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms