Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LANCL1O43813 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LANCL1O43813 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms