Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTATSF1O43719 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms