Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCXO43602 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCXO43602 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCXO43602 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCXO43602 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCXO43602 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCXO43602 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCXO43602 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCXO43602 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCXO43602 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCXO43602 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms