Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERI3O43414 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERI3O43414 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERI3O43414 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERI3O43414 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms