Protein–RNA interactions for Protein: O43316

PAX4, Paired box protein Pax-4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX4O43316 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX4O43316 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAX4O43316 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX4O43316 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX4O43316 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAX4O43316 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAX4O43316 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAX4O43316 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms