Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRXO43186 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRXO43186 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRXO43186 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRXO43186 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRXO43186 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRXO43186 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRXO43186 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRXO43186 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRXO43186 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRXO43186 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms