Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIPA1L1O43166 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIPA1L1O43166 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms