Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLOCKO15516 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLOCKO15516 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms