Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD28O15084 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD28O15084 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms