Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APAF1O14727 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
APAF1O14727 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APAF1O14727 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APAF1O14727 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APAF1O14727 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APAF1O14727 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APAF1O14727 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
APAF1O14727 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
APAF1O14727 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms