Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRTO14522 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRTO14522 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRTO14522 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
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