Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H7C1W4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
H7C1W4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H7C1W4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H7C1W4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H7C1W4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H7C1W4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H7C1W4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H7C1W4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
H7C1W4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
H7C1W4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H7C1W4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms