Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-2B6SEH9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms