Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
B4DEV8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
B4DEV8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
B4DEV8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
B4DEV8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
B4DEV8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DEV8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
B4DEV8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms