Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SMIM1B2RUZ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMIM1B2RUZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms