Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MEIS3P2A8K0S8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms