Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YJEFN3A6XGL0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YJEFN3A6XGL0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms