Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC69A6NI79 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms