Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEMP2A6NFY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms