Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA8A3KMH1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms