Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F8A0AVK6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F8A0AVK6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms