Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J276

TRAV25, T-cell receptor alpha variable 25 (Fragment), humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV25A0A0B4J276 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAV25A0A0B4J276 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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