Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.953e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.813e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 PPP1CC-205ENST00000550261 747 ntTSL 53.79□□□□□ -1.83e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 AARSD1-213ENST00000491665 762 ntTSL 211.54□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 AARSD1-212ENST00000486664 648 ntTSL 311.02□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 AARSD1-208ENST00000478040 561 ntTSL 28.47□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 10.4
SF3B4Q15427 LZTR1-214ENST00000492480 695 ntTSL 316.74■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-209ENST00000579483 5141 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.812e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 25.18□□□□□ -1.582e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-219ENST00000584476 465 ntTSL 35.09□□□□□ -1.592e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.69□□□□□ -1.662e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 23.79□□□□□ -1.82e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 23.71□□□□□ -1.822e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 33.08□□□□□ -1.922e-9■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ANPEP-202ENST00000558177 918 ntTSL 37.65□□□□□ -1.183e-12■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SF3B2-203ENST00000524627 841 ntTSL 311.66□□□□□ -0.544e-12■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 TMEM39A-209ENST00000486235 885 ntTSL 35.84□□□□□ -1.473e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CD2AP-204ENST00000479857 404 ntTSL 33.14□□□□□ -1.919e-12■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 NEMF-204ENST00000554275 873 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 216.35■□□□□ 0.212e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt12.33□□□□□ -0.442e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RACGAP1-228ENST00000552921 563 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RACGAP1-214ENST00000548644 624 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RACGAP1-205ENST00000546723 574 ntTSL 29.27□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RACGAP1-223ENST00000551260 555 ntTSL 45.32□□□□□ -1.563e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 TNRC6A-209ENST00000562829 277 ntTSL 215.33■□□□□ 0.047e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PPFIA4-205ENST00000486360 4547 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PPFIA4-207ENST00000594656 560 ntTSL 411.73□□□□□ -0.532e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 TARDBP-207ENST00000476201 929 ntTSL 513.04□□□□□ -0.324e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MLLT10-207ENST00000430455 184 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.355e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.585e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.585e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.585e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 311.31□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 TARDBP-205ENST00000473118 701 ntTSL 36.89□□□□□ -1.314e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.465e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ARFIP2-207ENST00000529847 920 ntTSL 219.76■□□□□ 0.755e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 KLHL24-212ENST00000481126 389 ntTSL 219.02■□□□□ 0.645e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 KLHL24-206ENST00000461813 587 ntTSL 418.06■□□□□ 0.485e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PRPF31-205ENST00000445811 928 ntTSL 516.76■□□□□ 0.271e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 HMBOX1-215ENST00000560599 1426 ntTSL 516.71■□□□□ 0.273e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-206ENST00000598273 2437 ntTSL 216.62■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.255e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.235e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 416.1■□□□□ 0.173e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-211ENST00000599874 636 ntTSL 214.9□□□□□ -0.025e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PRPF31-204ENST00000445124 886 ntTSL 514.78□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PRPF31-206ENST00000447810 854 ntTSL 514.78□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 UXT-205ENST00000485641 627 ntTSL 314.66□□□□□ -0.065e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 414.59□□□□□ -0.073e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-213ENST00000601419 717 ntTSL 214.58□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 514.47□□□□□ -0.093e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 514.26□□□□□ -0.135e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 414.23□□□□□ -0.133e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RBBP4-218ENST00000527118 700 ntTSL 314.19□□□□□ -0.143e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ADCY3-213ENST00000606682 3136 ntTSL 214.18□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 UXT-203ENST00000376964 894 ntTSL 213.97□□□□□ -0.175e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.255e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RBBP4-205ENST00000445722 580 ntTSL 213.37□□□□□ -0.273e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-242ENST00000601648 745 ntTSL 313.15□□□□□ -0.35e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.315e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.315e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-244ENST00000602127 749 ntTSL 512.88□□□□□ -0.355e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.355e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-313ENST00000628917 490 ntTSL 512.88□□□□□ -0.355e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-217ENST00000451982 1161 ntTSL 512.55□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-13■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 HRAS-210ENST00000482021 167 ntTSL 312.09□□□□□ -0.475e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.485e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.545e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-207ENST00000598956 1032 ntTSL 211.58□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RBBP4-203ENST00000401893 762 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 RBBP4-215ENST00000524393 583 ntTSL 311.54□□□□□ -0.563e-10■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PTK2-204ENST00000510126 580 ntTSL 411.47□□□□□ -0.571e-8■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-276ENST00000626706 608 ntTSL 511.39□□□□□ -0.595e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 511□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SLC25A5-202ENST00000460013 775 ntTSL 310.94□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-264ENST00000626089 792 ntTSL 510.92□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 510.77□□□□□ -0.695e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 310.67□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 SELENOW-203ENST00000595509 675 ntTSL 310.59□□□□□ -0.715e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-297ENST00000627767 929 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.755e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 510.31□□□□□ -0.765e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CTNND1-224ENST00000530068 579 ntTSL 410.29□□□□□ -0.765e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 PPP1R12B-209ENST00000466273 350 ntTSL 510.16□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 GOLGA2-211ENST00000496221 450 ntTSL 39.69□□□□□ -0.862e-13■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 LINC00969-230ENST00000597034 731 ntTSL 59.4□□□□□ -0.95e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 CELF1-219ENST00000539254 572 ntTSL 48.74□□□□□ -1.015e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 POLA2-202ENST00000525924 873 ntTSL 58.57□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 10.3
SF3B4Q15427 ADCY3-207ENST00000450524 571 ntTSL 48.54□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 10.3
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