Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
MAP3K4Q9Y6R4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MAP3K4Q9Y6R4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms