Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms