Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXND1Q9Y4D7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXND1Q9Y4D7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms