Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIF3AQ9Y496 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIF3AQ9Y496 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms