Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP3Q9Y446 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PKP3Q9Y446 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms