Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHTOPQ9Y3Y2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms