Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1Q9Y3T6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms