Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UTP11Q9Y3A2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UTP11Q9Y3A2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms