Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms