Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNQ9UQP3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNQ9UQP3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms