Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN6Q9UQ52 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN6Q9UQ52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms