Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPS5Q9UPZ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS5Q9UPZ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms